מרבית שפכי התעשייה בישראל מוזרמים לטיפול במכוני טיהור השפכים, המטפלים גם בשפכים הסניטריים. החל מ 2011 נכנסו לתוקף כללי  תאגידי מים וביוב (שפכי מפעלים המוזרמים למערכת הביוב הציבורית).

שפכי התעשייה עלולים להכיל מזהמים שונים שטווח השפעתם רחב כגון: פגיעה במערכת הביוב, סתימות ביוב רבות ונזק לציוד אלקטרו-מכני, פגיעה באיכות מי קולחים, פגיעה בערכי הסביבה ובאיכות החיים של התושבים.
עדכון לכללים אלו יצא ב- 2014 ובהם נכללים ערכי רכיבים מירביים המותרים להזרמה למערכת הביוב.
הפרמטרים מחולקים לחריגים ואסורים ועל כל חריגה המפעל נדרש לשלם אגרות בשל עלות הטיפול הנוספת הנדרשת לצורך הרחקת המזהם ו/או עלות הנזג שנגרם כתוצאה מהזרמת המזהם במטרה לשמור על איכות הסביבה ומניעת קנסות ועלויות נוספות על המפעל

במסגרת תהליך הליווי, המפעל יקבל:

• ייעוץ והכוונה וכן דרכים לצימצום
• טיפול באיכות השפכים
• הבאת המפעל להזרמת שפכים באיכות תקינה